COMPÀREGENOME
BIOECOPEST - COMPÀREGENOME
L’introduzione delle tecniche di Next Generation Sequencing (NGS) rappresenta una pietra miliare per la biologia e gli studi di ricerca genetica, consentendo agli scienziati di studiare diversi aspetti degli organismi attraverso l’analisi delle relative sequenze di DNA. Combinato con gli studi tradizionali di laboratorio, l’analisi di un singolo gene o del genoma completo contribuisce a fornire informazioni dettagliate su una specie di organismi. In conseguenza di questa innovazione, il numero di genomi sequenziati disponibili è aumentato rapidamente e molti strumenti bioinformatici sono stati sviluppati per processare i dati genomici durante le diverse analisi. Tuttavia, al momento non esiste un metodo standard e una sequenza chiara di quali tools utilizzare nei primi stadi delle analisi e spesso gli scienziati, procedendo per tentativi ed errori, impiegano molto tempo prima di estrarre le informazioni desiderate.
Bioecopest, per semplificare questo processo, ha sviluppato CompàreGenome (Moro et al., 2024), un innovativo strumento bioinformatico per la comparazione genomica di cellule sia procarioti sia eucarioti attraverso l’analisi del Whole Genome Sequences. CompàreGenome identifica con un elevato livello di precisione ed efficacia le sottili differenze genetiche che intercorrono tra diversi genomi, evidenziando le più piccole variazioni e traducendo gli output tecnici dell’analisi in informazioni pronte all’uso, come ad esempio:
- La distanza genetica stimata,
- L’identificazione dei geni maggiormente conservati e maggiormente differenti,
- I processi biologici associate ai diversi gruppi di geni,
- La distinzione degli organismi fino a livello di ceppo/cultivar, e molto altro.
CompàreGenome risolve facilmente il problema di quale tool utilizzare nei primi stadi dell’analisi di comparazione genomica, traducendo risultati tecnici in informazioni biologicamente rilevanti!
